La Unidad de Gestión de la Calidad del Hospital San Juan de Lurigancho es el órgano de asesoría encargada de implementar el Sistema de Gestión de la Calidad, mediante acciones y proyectos de mejora continua a nivel asistencial y administrativo, con la participación activa del personal de salud.
Cabe señalar que la Organización Mundial de la Salud afirma: "Una atención sanitaria de alta calidad es la que identifica las necesidades de salud (educativas, preventivas, curativas y de mantenimiento) de los individuos o de la población, de una forma total y precisa y destina los recursos (humanos y otros), de forma oportuna y efectiva”. Asimismo Avedis Donabedian define la calidad como “La capacidad de alcanzar el mayor beneficio posible deseado teniendo en cuenta los valores de los individuos y de las sociedades”.